Епископ Нестор родился 4 сентября 1974 года в Москве, Россия.
После школы с 1991 по 1995 год учился в Историко-архивном институте (ныне Российский государственный гуманитарный университет).
Он прибыл во Францию в 1999 году, чтобы продолжить обучение в Свято-Сергиевском православном богословском институте.
Несколько лет будущий епископ был настоятелем православного прихода Аньер (Экзархат русских приходов Западной Европы Константинопольского Патриархата).
В 2004 году вернулся в Московский Патриархат, став членом клира Херсонесской епархии.
С 2008 года он был настоятелем приходов Херсонесской епархии во Франции и настоятелем церкви Труа-Сент-Доктор в Париже. он также преподает пастырское богословие в Русской православной семинарии в Эпине-су-Сенар.
Священным Синодом Русской Православной Церкви 31 мая 2010 года назначен епископом Кафским, вспомогательным Херсонесской епархии. Его архиерейская хиротония была совершена в храме Христа Спасителя в Москве 5 сентября 2010 года в память святителя Иринея Лионского.
24 декабря 2010 года Священный Синод назначил монсеньора Нестора ординарием Херсонесской епархии.
Решением Священного Синода от 28 декабря 2018 года (дн. № 105) епископ Нестор назначен епископом Мадридским и Лиссабонским.
3 января 2019 года Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом монсеньор Нестор возведен в сан архиепископа. 
Решением Священного Синода от 7 июня 2022 года (дневник № 61) епископ Нестор назначен временным управляющим Херсонесской епархией.
Решением Священного Синода от 13 октября 2022 года (дн. № 96) Высокопреосвященнейший Нестор, Архиепископ Мадридский и Лиссабонский, назначен Титулярным Архиепископом Херсонесской Епархии и Главой Патриаршего Экзархата в Западной Европе с титулом « Херсонеса и Западной Европы».
27 ноября 2022 года Святейшим Патриархом Московским и всея Руси Кириллом архиепископ Нестор возведен в сан митрополита.